SMP Negeri 1 Alian beralamat di Jalan Pemandian Nomor 146 Kebumen tepatnya di Desa Krakal Kecamatan Alian Kabupaten Kebumen. Sekolah ini merupakan Sekolah Menengah Pertama (SMP) Negeri pertama di Kecamatan Alian, berdiri pada tahun 1979 di atas tanah milik Departemen Pendidikan dan Kebudayaan Kabupaten Kebumen seluas 13.474 m² dengan status hak pakai. Lokasi sekolah berada di jalan raya yang menghubungkan kota kebumen dengan obyek wisata Pemandian Air Panas dan Pasar Indrakila Alian, tepatnya di depan Kantor Kepolisian Sektor (POLSEK) dan Kantor Komandan Rayon Militer (DANRAMIL) Alian.

SMP Negeri 1 Alian berada di pusat Kota Kec. Alian, sehingga mudah dijangkau dari berbagai arah. Berdasarkan keterangan dari Kepala SMP Negeri 1 Alian yang menjabat periode kedua yaitu Slamet Hs, BA dan informasi dari komite sekolah, rintisan SMP Negeri 1 Alian ini dimulai pada tahun 1955 dengan nama SMP Indrakila. Pada awal berdirinya itu Kepala Sekolahnya bernama Nahrowi. Situasi dan kondisi negara pada waktu itu yang tidak kondusif untuk penyelenggaraan pendidikan, tepatnya pada tahun 1957 SMP Indrakila ini dibubarkan.                       

Awal tahun 1972 di wilayah Kecamatan Alian berdiri lagi SMP dengan nama SMEP (Sekolah Menengah Ekonomi Pertama) dengan Kepala Sekolah Hasyim. Usia sekolah ini juga tidak berlangsung lama. Setelah menamatkan siswa pertama, tahun 1975 SMEP ini digabung denga SMP Tamtama Kebumen. Berbagai kendala terutama berkaitan dengan keterbatasan dana, sarana dan prasarana menjadi pertimbangan rasional penggabungan SMEP ini.

Beberapa tahun berikutnya, tepatnya tahun 1976 berdiri SMP PEMDA Alian, sebagai persiapan SMP Negeri yang pertama di kecamatan Alian. Pada tahun 1976 para tenaga kependidikan membentuk kepanitiaan sebagai persiapan pendirian SMP Negeri  Alian. Melalui Surat Keputusan Menteri Pendidikan dan Kebudayaan Nomor 0188/O/1979 tanggal 3 September 1979 nama SMP Negeri Alian ditetapkan secara resmi, dan memulai tahun pelajar untuk pertama kalinya tahun 1978/1979.

Perubahan nama SMP Negeri Alian menjadi SMP Negeri 1 Alian sejak adanya pendirian SMP Negeri 2 Alian di desa Poncowarno yang sekarang menjadi SMP Negeri 1 Poncowarno, sebagai konsekuensi pemekaran wilayah kecamatan Alian. Status Terakreditasi A ditetapkan berdasarkan Surat Keputusan Badan Akreditasi Sekolah (BAS) Kabupaten Kebumen Nomor 28/BAS.DA/KEP/XII/2005 tanggal 24 Desember 2005, dan bertahan pada dua kali akreditasi berikutnya. Sedangkan status SSN (Sekolah Standar Nasional) diperoleh pada tahun 2008 berdasarkan Surat Keputusan Direktorat Pembinaan SMP-Dirjen Managemen Pendidikan Dasar dan Menengah Departemen Pendidikan Nasional Nomor 036/C3/DS/2008 pada waktu Kepala Sekolah dijabat oleh Ibu Wihardiningsih, S.Pd.

Berdasarkan data sekolah, menunjukkan bahwa SMP Negeri 1 Alian telah mengalami sepuluh (10) kali pergantian Kepala Sekolah.

Berikut nama-nama Kepala Sekolah SMP Negeri 1 Alian berdasarkan kurun waktunya hingga sekarang.

1. Bagyo Sutarman: 01-03-1980 s.d. 25-02-1986
2. Slamet Hs, BA: 01-03-1986  s.d.  31-03-1989
3. Sutari Suhadi: 01-04-1989  s.d.  31-01-1993
4. Paulus Sugiharto: 01-02-1993  s.d.  31-01-1996
5. Drs. Martoyo: 01-02-1996  s.d.  01-10-2002
6. Drs. Muchlasin SW: 01-11-2002  s.d.  01-08-2003
7. Drs. Sumeri: 04-08-2003  s.d.  10-09-2003
8. Wihardiningsih, S.Pd: 11-09-2003  s.d.  11-09-2011
9. Drs. Suharsono, M.Pd: 30-12-2011  s.d.  28-12-2015
10. Dra. Murilah, S.Pd: 30-12-2015  s.d.  30-12-2019
11.Akhmad Mitrawan, S.Pd., M.Pd.: 30-12-2019  s.d.  sekarang